يقدم مصرف المستشار الاسلامي افضل الخدمات لزبائنه من خلال تحصيل صكوكهم واوامر الدفع الخاصة بهم بين فروع المصرف والمصارف الاخرى وفروعها عن طريق نظام المقاصة الالكترونية (ACH وهو نظام يمكن المصارف المشاركة وفروعها من تبادل أوامر الدفع منخفضة القيمة فيما بينهم بطريقة آلية، وتتم المعالجة وإرسال صافي التسوية النهائية عن طريق ال RTGS ، وكذلك يتم من خلال النظام تبادل الصكوك الإلكترونية المرمزة .